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Use of chromogenic medium and semi-nested PCR-based assay to identify Candida species

Utilização de um meio cromogênico e da técnica de semi-nested PCR para identificação de espécies de Cândida

dc.creatorOliveira, Narjara do Carmo
dc.creatorRampazzo, Rita de Cássia Pontello
dc.creatorMinari, Mariana Caldas
dc.creatorCorrêa, Paulo Roberto Ceridório
dc.creatorCarneiro, Marcelo
dc.creatorSvidzinski, Terezinha Inez Estivalet
dc.creatorMaia, Luciana Furlaneto
dc.creatorYamada-Ogatta, Sueli Fumie
dc.date2006-12-15
dc.date.accessioned2022-10-18T19:43:15Z
dc.date.available2022-10-18T19:43:15Z
dc.identifierhttps://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/seminabio/article/view/3511
dc.identifier10.5433/1679-0367.2006v27n2p125
dc.identifier.urihttp://www.labtecgc.udesc.br/tabd1/handle/123456789/483
dc.descriptionIn this study, the chromogenic medium CHROMagar Candida™ and semi-nested PCR-based assay (sn- PCR) were compared in relation to their capacity to identify the species of 52 clinical isolates of Candida sp. By using the chromogenic medium, 39 (75%) yeasts isolates were presumptively identified as C. albicans (n = 22), C. glabrata (n = 9), C. tropicalis (n = 5) and C. krusei (n = 3). Thirteen isolates (25%) were not distinguishable to the species level. Through the sn-PCR, that is based on the ribosomal RNA genes (5.85 – 28S) cluster amplifications, 43 (83%) isolates were identified as C. albicans (n = 24), C. glabrata (n = 11), C. tropicalis (n = 5), C. parapsilosis (n = 3) and nine isolates could not be identified to the species level. Among the 52 analyzed isolates, 34 (65.4%) were in accordance with both methods, 12 (23.1%) showed discrepant results, and 6 (11.5%) could not be identified by any of the methodologies. The results indicate that both methods are limited, but the sn-PCR is more adequate than the chromogenic medium to identify species of the Candida genus, due to the lowest number of isolates that could not be identified.en-US
dc.descriptionNesse trabalho, o meio cromogênico CHROMagar Candida e a técnica de semi-nested PCR (sn-PCR) foram comparados quanto a sua capacidade de identificar a espécie de 52 isolados clínicos de Cândida sp. Com o emprego do meio cromogênico, 39 (75%) isolados foram identificados presuntivamente como C. albicans (n = 22), C. glabrata (n = 9), C. tropicalis (n = 5) e C. krusei (n = 3). Treze isolados (25%) não puderam ser identificados. Por meio da técnica de sn-PCR, que se baseia na amplificação de uma região do cluster gênico do RNA ribossomal (5.8S – 28S), 43 (83%) isolados foram identificados como C. albicans (n = 24), C. glabrata (n = 11), C. tropicalis (n = 5), C. parapsilosis (n = 3) e nove isolados não puderam ser identificados em nível de espécie. Entre os 52 isolados analisados, 34 (65,4%) apresentaram resultados concordantes pelos dois métodos, 12 (23,1%) apresentaram resultados discrepantes, e 6 (11,5%) não puderam ser identificadas por nenhuma das duas metodologias. Os resultados indicam que ambas as técnicas apresentam limitações, mas o método de sn-PCR é mais adequado que o meio cromogênico para a identificação de espécies do gênero Candida, devido ao menor número de isolados que não puderam ser identificados.pt-BR
dc.formatapplication/pdf
dc.languagepor
dc.publisherUniversidade Estadual de Londrinapt-BR
dc.relationhttps://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/seminabio/article/view/3511/2844
dc.rightsCopyright (c) 2016 Semina: Ciências Biológicas e da Saúdept-BR
dc.sourceSemina: Ciências Biológicas e da Saúde; Vol. 27 No. 2 (2006); 125-132en-US
dc.sourceSemina: Ciências Biológicas e da Saúde; v. 27 n. 2 (2006); 125-132pt-BR
dc.source1679-0367
dc.source1676-5435
dc.subjectCandida sp. Identification. CHROMagar médium. Semi-nested PCR.en-US
dc.subjectCandida sppt-BR
dc.subjectIdentificaçãopt-BR
dc.subjectMeio CHROMagarpt-BR
dc.subjectSemi-nested-PCR.pt-BR
dc.titleUse of chromogenic medium and semi-nested PCR-based assay to identify Candida speciesen-US
dc.titleUtilização de um meio cromogênico e da técnica de semi-nested PCR para identificação de espécies de Cândidapt-BR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typeArtigo avaliado pelos Parespt-BR


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